Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms