Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCND1Q9NSA2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms