Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HDAC8Q9BY41 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDAC8Q9BY41 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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