Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms