Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms