Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C9orf16Q9BUW7 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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