Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
FAM19A4Q96LR4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
FAM19A4Q96LR4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms