Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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