Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms