Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms