Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C5orf17Q8NAS9 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
C5orf17Q8NAS9 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms