Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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ANKRD42Q8N9B4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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ANKRD42Q8N9B4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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ANKRD42Q8N9B4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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ANKRD42Q8N9B4 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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ANKRD42Q8N9B4 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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ANKRD42Q8N9B4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ANKRD42Q8N9B4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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