Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC117Q8IWD4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms