Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKL3Q8IVW4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms