Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASSF3Q86WH2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms