Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms