Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMBR1LQ6UX01 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms