Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms