Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms