Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CCDC142Q17RM4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CCDC142Q17RM4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CCDC142Q17RM4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CCDC142Q17RM4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CCDC142Q17RM4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CCDC142Q17RM4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CCDC142Q17RM4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CCDC142Q17RM4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CCDC142Q17RM4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CCDC142Q17RM4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CCDC142Q17RM4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CCDC142Q17RM4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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