Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP6Q16828 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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