Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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