Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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NDUFA9Q16795 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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NDUFA9Q16795 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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NDUFA9Q16795 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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NDUFA9Q16795 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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NDUFA9Q16795 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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NDUFA9Q16795 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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NDUFA9Q16795 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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NDUFA9Q16795 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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