Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDKN3Q16667 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms