Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTRK3Q16288 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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