Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PMCHL1Q16048 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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PMCHL1Q16048 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PMCHL1Q16048 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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