Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCOA1Q15788 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms