Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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