Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms