Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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