Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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