Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM2Q13029 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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