Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF5Q12774 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms