Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC173Q0VFZ6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC173Q0VFZ6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms