Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DSC2Q02487 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms