Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN10P78369 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms