Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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UBE2NP61088 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2NP61088 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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