Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CASP6P55212 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CASP6P55212 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms