Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPHB4P54760 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms