Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms