Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms