Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms