Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5C1P36542 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms