Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms