Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E1P29083 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms