Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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PTPRMP28827 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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PTPRMP28827 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21■□□□□ 0.95
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PTPRMP28827 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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PTPRMP28827 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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PTPRMP28827 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTPRMP28827 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTPRMP28827 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTPRMP28827 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTPRMP28827 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRMP28827 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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