Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms