Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD58P19256 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD58P19256 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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