Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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