Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC9O60706 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC9O60706 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms